第123章 種質資訊管理(第1/3 頁)

一、種質資訊管理

種質資源的儲存，除資源材料本身外，還應包括種質資源的各種資料，對每份資源材料均應有其檔案，檔案資料在條件許可時，應輸入計算機儲存，建立資料庫，以便於資料檢索、分類和開展有關的研究工作。

目前，世界上不少國家和國際農業研究機構都相繼建立了種質資訊計算機管理系統。儘管其規模、組織和功能方面存在差異，但它們的作用大體相同。

我國已建成國家作物種質資源資訊系統(CGRIS)

1、種質資料型別

基礎資料：包括登記材料資料和蒐集資料、登記材料號、採集編號

鑑定和評價資料 :植物學性狀、經濟性狀、品質性狀、對病蟲害的反應、對環境的適應性

管理資料 ：包括接納日期、種質編號、入庫定位種子起始發芽率等等。

交換資料： 交換目錄內有關種引進和分發的資料。

2、種質資訊系統型別

種質資訊系統按其主要特徵分為三類：

（1）檔案系統

（2）資料庫系統

（3）網路系統（美國的GRIN）

3、植物遺傳資源協作網:在國際上建立起來的種質資訊管理與交換系統。建立植物遺傳資源協作網目的是利用長期種質庫妥善儲存種質資源，透過資料庫系統提供資訊和資料，並藉助中期庫分發種質資源。

（1）地區協作網

（2）作物協作網

（3）長期庫協作網

（4）以課題為基礎的協作網

二、核心樣品的建立

1、核心種質的含義

澳大利亞科學家Frankel(1984)首次提出了核心收集品的概念，並與Brown(1989)對其做了進一步發展和完善。核心樣品(corecollection)：是指用最小的種質資源樣品量最大程度的代表種質資源的遺傳多樣性。

一般來說，一個物種的核心種質約佔其全部種質的5－10%，至少代表該物種70%的遺傳多樣性 。

IBPGR（國際植物遺傳資源委員會）認為，核心種質庫是能以最少的重複代表一個種及野生近緣種的形態特徵、地理分佈、基因與基因型的最大範圍的遺傳多樣性。

近年來，核心種質的概念已延伸到無性繁殖作物、DNA種質庫及種質資源的原位儲存研究領域

核心種質應具有異質性、多樣性、代表性、實用性和動態性

2、構建核心種質的方法

核心種質的構建有以下幾種方法：

（1）按產地來源進行構建

（2）按分類系統進行構建

（3）按農藝性狀表現進行構建

（4）利用分子標記進行構建

以上方法結合使用，構建核心種質更為準確

3、建立核心樣品的程式

（1）資料收集：從種質資訊管理系統

（2）分組：將具有相似性狀的樣品歸為一類， 逐級分類，沒有資料的樣品單獨分組。

（3）選擇：即確定每組選擇的數量和物件

（4）建立核心樣本（庫）：對選擇出來的核心樣品進行鑑定，確保它們是來自不同組的代表，繁殖核心樣品，建立該種作物核心種質庫。

建成的核心種質庫需不斷完善、更新

4、發展核心種質應注意的幾個問題

（1）核心種質不能替代整個種質蒐集品。

（2）核心種質的構建需要多學科的交叉知識。

（3）核心種質的構建還沒有一套成型的