第十六章 GCCGCCAGTTCC(第1/3 頁)

傍晚，他被接二連三的電話吵醒。三家測序公司全都散發著大號拖延症的氣質，像是約好了一樣，在承諾時效的前一天晚上才和他溝通。

溝通的內容無非就是懷疑樣本被汙染了，所以提前宣告不對測序結果的解讀負責。

盧赫見怪不怪地一頓“嗯嗯啊啊好好好”迅速把他們都給打發了，隨後郵箱被測序報告塞滿。

他從床上爬起來，穿戴整齊，甚至用梳子蘸水梳了頭髮。

隨後他鄭重地走下樓，走進細胞間，一屁股坐在電腦前，伸手去手撈椅背，把正在忙碌的菜菜一把拽了過來。

“歇會兒歇會兒，陪我吃瓜。”

這次他們率先開啟了基因組原始資料。基準30億個鹼基對，有效分析了30億個鹼基對。Gc含量57%。

怎麼還是這麼高？

兩人的腦袋湊在一起，緊盯著螢幕上緩緩滑過的密密麻麻的字元。這次依然是滿屏的紅和綠，但紅多綠少。

“停！”菜菜指著剛掠過的一段字元驚呼，“你看這段，GccGccAGttcc，這不是終止子嗎？”

盧赫定睛一看，“是啊，這是轉錄終止修飾點，而且是依賴Rho因子[1]的的轉錄終止。”

“終止，好多終止，全是終止！”菜菜又一次驚呼，“停！這段，Gc區[2]下游怎麼沒有tAtA區[3]啊。我只知道組蛋白可以沒有Gc區，這沒有tAtA區的是什麼鬼啊？”

滑鼠繼續翻動，兩人逐漸陷入沉默。

許久之後，盧赫打破了這死寂的氣氛，但從他嘴裡說出的並不是菜菜所期待的正經話。

“真是離譜他媽給離譜開門，離譜到家了。”他邊感慨邊點開了剛剛下載好的線粒體基因，在軟體載入期間合了好幾下眼。

軟體載入完成，線粒體基因沒有太多註釋，可翻了幾下後，兩人還是猶如半截木頭般僵在那裡。從地下室天窗投射出的一縷橙紅色的陽光，緩緩從盧赫的臉上掠過，他連眼睛都沒眨一下。

漸漸的，天色完全暗下來，電腦螢幕上反射出天花板上白熾燈管的輪廓，正好遮擋住螢幕的正中央。

“GGAGGGcGAGGctccGtcctAGccttG。。。”盧赫偏了偏頭，默唸著其中的一段鹼基序列，重啟電腦進了Linux，然後在命令列下快速敲擊。

一頓操作下來，他揉著脖子對著黑色背景下一格一格往前爬的亮白色進度條沉思。一旁的菜菜眯著眼睛念出命令列中的小字：“cRISpR。。。cas。。。Finder？你不會真以為他會有cRISpR系統吧？這太荒誕了。”

盧赫揉亂了自己的頭髮，“葫蘆上藤上結南瓜。咱們搞研究的，總得有點兒想象力吧。”

不一會兒，軟體裝好了。他在命令列敲出一大行命令：perl cRISpRcasFinder.pl -in Stupid_turtle.fna -out Stupid_turtle_crispr_cas -def General -cas -ccvr -ccc -gscf -keep -html -cpum 32 -cpup 32 -xr 555 -md 50 -t 50

按下回車鍵後，藏在桌子背面的大機箱嗡嗡地運轉了起來。

“法國人搞出來的開源軟體，能預測cRISpR序列和cas的位置。他究竟是不是大細菌，是什麼樣的大細菌，等會兒一目瞭然。”

他說完戳了戳還在發愣的菜菜，“喂，怎麼還僵著呢。你對新事物的接受能力完全不行啊。看來老呆在這兒幹體力活也不行，回頭你每週給我做兩次文獻彙報吧。記得看最新的，保準跟科幻小說一樣給你看