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拿破崙懷著憂鬱而煩悶的心情用潦草的字跡寫下了大量甚至次日早上連他自己也難以辨認的手稿。在1786年到1791年期間，他寫了無數文章，包括對諸如巴隆·德·泰爾等各級將領提出的有關改進炮位和彈道的有數學計算依據的詳細建議。

拿破崙還研究了降低軍火庫之間炮彈運輸費用的方案。泰爾對這位與眾不同的下級軍官留下了極深的印象，對他再也不會忘記。

就這樣，當其他軍官在樓下的咖啡館裡或是在軍團駐地酗酒、賭博和嚎叫時，拿破崙卻在挑燈夜讀。他斗室裡的燈光似乎從不熄滅，同時他第二天仍然有充沛的精力。他研究了瑞士的地理和土耳其的歷史、印度的政府和阿茲臺克的宗教。他對知識的渴求真是慾壑難填。

拿破崙在此期間寫下的所有筆記、信函和追思錄中，最長、最有趣的文章是對暴政的論述，特別是對法國在科西嘉實施的暴政。拿破崙是個憤怒的理想主義者，抗議這個世界上遭受蹂躪者所施的弱肉強食的暴政。

“使用蠻力是叢林中的法則，理性的力量才是人所具有的。”　他這樣開始這篇文章，“多少國家為此歷經滄桑和盛衰變遷！……暴政、壓迫和不公平正在瀰漫全球……”科西嘉的命運就是“小國希望自由而其鄰國想要壓迫”的一個最好的例子。

然而，國家領袖的任務是“使他統治下國泰民安、社會繁榮昌盛。為了達到此目的，在理性火炬的引導之下，他必須公正地平衡他所負責的人民的權利。要做到這點，他必須隨時承擔國家要求的一切義務……我們生來是為了享受生活的”。但是，現在處於“法國人的鎖鏈”之下的科西嘉人在波旁王朝和派駐該島的行政長官的專制統治下卻毫無權利可言。“我拜讀過所有君主主義者雄辯家的演說，其中不外是用蹩腳的努力來企圖維護一個很壞的理由”——在現實中，它們都是濫用權力的藉口，如同在他的祖國所發生的那樣。“這世上一半的人都是抱負不凡的，並在獲取榮譽中追尋快樂。　對榮耀的熱愛使他們希望得到權力、敢於冒險（如國家的領袖和行政長官）、他們被這種指揮的權力所誘惑。”但是，他論證道：“我們之中最警覺的人……卻反對並揚棄了這種權力。”任何暴君或暴政的強權都是建立在“強力”——刺刀的基礎之上的。“我們是否繼續眼看（法國）軍隊在（科西嘉）為所欲為地執行他們的專橫統治而無動於衷呢？我們是否繼續在（法國）軍隊、總督和財政官員的三重枷鎖之下俯首帖耳任憑他們對我們的祖國進行巧取豪奪呢？”“像法蘭西這樣一個經過知識啟蒙的民族怎麼會在我們的誓約及他們行動的直接結果面前完全麻木不仁呢？……在上帝的眼中，最大的罪惡莫過於對人施行暴政，其次的罪惡便是忍受這種暴政！……人類！人類！你受奴役的狀態是多麼可悲，但是，一旦燃起熱情的自由的火焰，又是多麼偉大呀！”“結束法國對科西嘉不公正的統治”，他的祖國需要一個救世主，“但是，是否會有另一個威廉·退爾再世”？

既然眼下是在為掠奪其祖國的法國人服役，拿破崙少尉提出了休假5個半月的要求並獲得了批准。

1786年秋，他乘船從土倫出發，於9月15日抵達心愛的科西嘉，這是他6年來第一次回到故鄉。他現在17歲。他的這次假期將延長到次年9月才返回法國。“科西嘉的威廉·退爾”（或者說差不多是）來啦！事實上，拿破崙此行的真正目的不是拯救科西嘉，而是透過辦理他父親臨死前留下的、其後被朝廷授權批准的最後一個專案的檔案，以資助他備受貧窮煎熬的母親。由於父親的這個排幹沼地並將其改造成果園的計劃，拿破崙獲得了數千法郎。他母親、舅舅費舍和哥哥約瑟夫用這筆錢購買了一兩艘小船，結果成了反抗外國勢力的海盜船，他們也因此被控有罪。拿破崙對此事瞭解多少不得而知