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途所有火車站均設立檢疫所，厲行檢疫。凱旋部隊歸國實施嚴格的檢疫制度，使傳染病的患病率得到了有效控制。

民間救護事業

日清戰爭中&ldo;日本赤十字社&rdo;是活躍在戰場上的醫療衛生民間組織，在陸軍衛生部的指揮下，從事醫療救護工作。戰爭爆發時，該組織向陸軍省請願，獲得軍方許可，社內救護員分派本土陸軍預備醫院或隨陸軍前往戰地醫院服務。救護員在野戰衛生長官的指揮下，依照戰時衛生勤務令的條例從事本職工作。最初，負責國內勤務的救護員被派往廣島預備醫院，之後隨著各地預備醫院的設立，相繼配屬各醫院協助工作。赤十字社救護員同時負責給清國俘虜中的患者治療。負責海外勤務的救護員分海上和陸上兩種，海上救護員配屬在患者輸送船上，協助陸軍省僱員負責運輸船上的船員、搭乘者的醫療工作。陸上救護員配屬第一軍仁川兵站醫院、清國各地兵站醫院履行職責。戰爭期間，日本赤十字社派遣的衛生勤務救護人員總計1,373人。旅居朝鮮釜山、元山、仁川的日本僑民各醫院，院長及職員共計22人，為軍方患者提供收容、醫療、護理等服務，也有一定數量的日本居民，組成志願人員參與傷病者的護理工作。1895年4月，日清兩國簽訂《馬關條約》，6月起赤十字社派遣勤務漸次取消，7月至12月全部救護員從清國撤回。

馬匹衛生

日軍在戰爭時期的馬匹衛生管理沿襲和平時期的管理條例。1894年8月，朝鮮釜山附近發生牛瘟疫，陸軍省立即派遣課員和數名獸醫加強對牛馬的衛生管理，防止用於軍需搬運的牛馬發生死傷減員。陸軍省課員對軍馬衛生、軍馬醫療、鐵蹄材料等進行詳細調查，同年制定實施冬季軍用馬匹防寒用毛毯的供應。各師團司令部、兵站監部、獸醫部，對馬匹衛生直接進行指導監督，各乘馬部隊附屬的獸醫負責馬匹日常診療管理。野戰部隊的馬匹傷病最多的是鞍傷，朝鮮戰役中，鞍傷佔患馬的418；清國本土作戰中佔2034；臺灣作戰中佔126；諸種消化不良及呼吸病的發病率次之。臺灣戰場馬匹發病率較高的還有面板病，佔患馬的25。其他病患如咬傷、踢傷、頭絡傷等外傷，佔全患馬的90。馬匹腺疫主要流行馬匹特有的細菌性傳染病，如鼻黏膜、喉頭黏膜等炎症引起發熱或淋巴結腫脹化膿。國內馬匹患病率佔全患馬的683；清國則佔399。日軍對馬匹疾病主因的研究表明，朝鮮及臺灣作戰是夏季，馬匹過度疲勞、體力減弱，易引起感染和併發症。而在遼東半島及山東戰場作戰時，處於冬季，馬匹的健康多有增進。日清戰爭全戰役期間，日軍患馬累計54,532匹，其中發病後殺死8,994匹，戰鬥原因造成死傷的馬207匹，其中死馬97匹、傷馬110匹。

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